El sistema lagunar Catazajá es un ecosistema complejo de humedales tropicales reconocido por su alto nivel de endemismo y su fauna altamente especializada, la cual provee de hábitat, alimento, refugio y áreas de crianza y reproducción a un elevado número de especies, entre las que se cuentan algunas en peligro de extinción, como el manatí.
El tipo de vegetación que la comprende es el de: Bosque Tropical Caducifolio, Bosque Tropical, Vegetación Sabanoide, Vegetación flotante. Flora: Palo tinto o Campeche, Jinicuil o Aguatope de montaña, Cuaulote o Tapaculo, Guamúchil, Sauce, Pompushuti o Algodón, además de la especie exótica conocida como lirio acuático; además de una rica y carfiada fauna como el Manatí, Nutria, Tamandúa norteño o Brazo fuerte, Coyote, Saraguato, Venado cola blanca, Pecari de collar, Mapache; Pato real, Vencejo collar blanco y Colibrí cola canela.
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